شرکت خدماتی، آموزشی و تحقیقاتی مرجعان خاتم (سهامی خاص) (دانش بنیان) به عنوان یک شرکت کاملا خصوصی و مستقل در سال 1380 در اداره کل ثبت شرکت ها و موسسات غیر تجاری استان تهران ثبت و فعالیت خود را در همان سال آغاز نمود.