شرکت فناپ در سال ۱۳۸۴ با سرمایه‌گذاری گروه مالی پاسارگاد و جمعی از متخصصان و کارآفرینان حوزه فناوری اطلاعات و ارتباطات تاسیس شد. ماموریت اولیه آن، ارائه خدمات نرم‌افزاری و سخت‌افزاری و مدیریت پروژه‌های فناورانه برای اعضای گروه مالی پاسارگاد بود.
فناپ در آغاز با تمرکز بر نرم‌افزارهای بانکی فعالیت خود را شروع کرد. اما امروز دامنه خدمات آن فراتر رفته و بانک‌ها، موسسات مالی و اعتباری و شرکت‌های بزرگ کشور را نیز در بر می‌گیرد. این شرکت اکنون در حوزه‌های متنوعی همچون مالی، بانکی و بیمه‌ای، ارتباطات و مخابرات، حمل‌ونقل هوشمند، سلامت هوشمند، مدیریت منابع سازمانی، زیرساخت ابری و مراکز داده، امنیت و هوشمندسازی فرآیندها فعال است.
فناپ با ارائه راه‌حل‌های نوآورانه و مطمئن، به یکی از بازیگران اصلی و اثرگذار صنعت فناوری اطلاعات و ارتباطات در کشور تبدیل شده است.